針對新疆地區的壤土板結和鹽堿化問題，可以考慮使用微生物菌劑進行防治。下面是具體的操作步驟：

1、選擇適合當地生態環境的微生物菌劑，例如具有促進植物生長和抗逆能力的根際微生物菌劑，如枯草芽孢桿菌等。

2、在適宜的時間和條件下，噴灑微生物菌劑，如在播種前后、灌溉后等時機。可以使用水溶液、涂抹劑或直接混合在土壤中使用。

3、配合土壤調理措施，如適量的有機肥料、石灰等，調整土壤pH值，改善土壤結構。

4、加強排水設施建設，以減輕土壤中的鹽分和水分積累，改善土壤環境。

5、種植耐鹽堿的品種，避免棉花幼苗在根系發黑僵死的情況發生。

需要注意的是，在使用微生物菌劑防治鹽堿化問題時，要結合具體的實際情況和具體的操作方案。同時，為了確保微生物菌劑的效果，應該選用質量可靠的產品，并按照說明書中的使用方法進行使用。